PROCESS SIMULATION SINTESIS PROTEIN {BIOLOGY XII IPA 5}

LAPORAN BIOLOGISIMULASI SINTESIS PROTEIN

Di susun oleh kelompok 3 {XI IPA 5} :

Ketua kelompok: Muhammad Arifin

Anggota

: 1. Ria Adekayanti Yasin 2. Jimy Motalisa Putra 3. Arya Abidmursyid

4. Ica Infanastasya Firatika

5. Anindya PurnamasariPEMERINTAH KABUPATEN SUMBAWA

DINAS PENDIDIKAN NASIONAL

SEKOLAH MENENGAH ATAS NEGERI 1 SUMBAWA BESAR

TAHUN AJARAN 2009/2010

1. PENDAHULUAN A. Latar Belakang Gambaran tentang sintesis protein dapat diibaratkan seperti saat kita memasak makanan.Protein kita ibaratkan sebagai makanan, agar dapat diperoleh makanan dengan cita rasa yang lezat maka diperlukan bahan dan proses yang tepat. Demikian juga dalam sintesis protein, bahan dan rangkaian prosesnya tertentu dan urut. Sintesis protein terjadi di dalam ribosom dan pengaturan sintesis protein dilakukan oleh DNA dan RNA di dalam inti.

Berkaitan dengan hal di atas, maka kami melakukan praktikum yang dibimbing oleh guru mata pelajaran biologi untuk memahami bahwa proses sintesis protein berlangsung di dalam sel.

B. Pengertian

Sintesis protein, yaitu proses penyusunan senyawa protein dengan membentuk rangkaian rantai polipeptida.

Senyawa-senyawa sebagai bahan dan pelaksana sintesis protein antara lain DNA (Rantai Sense dan Rantai Antisense), RNA duta, RNA transfer, RNA ribosom.Tahapan proses sintesis protein antara lain seperti berikut.

a. Transkripsi

Transkripsi adalah pencetakan mRNA (kode) oleh DNA (DNA template/DNA sense) dengan menggunakan enzim RNA polimerase. Adanya enzim RNA polimerase ini akan menyebabkan rangkaian double helix sebagian akan membuka, akibatnya basa-basa pasangannya menyusun Adenin (A) pada mRNA dan seterusnya. Hasil penyusunan mRNA yang sudah jadi akan meninggalkan inti untuk melekat pada ribosom, yang merupakan organela pelaksana sintesis protein.

b. Translasi

Kode pada mRNA akan terbaca oleh ribosom dengan dibantu oleh tRNA yang terdapat di dalam sitoplasma. tRNA akan datang untuk membawa asam amino yang sesuai dengan kode yang dibawa mRNA tersebut. Kemudian tRNA akan bergabung dengan mRNA yang sesuai dengan kode pasangan basa. Bagian pada tRNA yang terlibat ini disebut antikodon, yang berhubungan dengan tiga basa pada pita mRNA yang disebut dengan kodon. Asam amino akan berjajar-jajar dalam urutan yang sesuai dengan kodenya. Dari hal ini akan terbentuk protein yang berfungsi sebagai enzim, dalam mengatur metabolisme sel dan reproduksi.S ( G

A ( T

A ( U

S ( G

Ket : S = sitosin

U = urasil

G = guanine

A = adeni

T = tinin

2. TUJUAN PRAKTIKUMMemahami bagaimana proses sintesis protein dapat berlangsung di dalam sel.3. METODELOGI SIMULASIPraktikum Biologi yang kami lakukan dapat kami pertanggungjawabkan karena telah dilakukan praktikum dengan cara kualitatif, dengan langkah-langkah sebagai berikut :

a. Menyiapkan alat-alat dan bahan-bahan

b. Melakukan simulasic. Menjawab pertanyaan

d. Membuat laporan4. Alat dan Bahan1. Kertas karton putih 7 lembar digunting menjadi 68 lembar ( ukuran dari kertas legal ).

2. Kertas karton warna ( merah, kuning, hijau, biru ),

3. Gunting, Lem, 4. Benang wol/ tali ( 60 cm ) 5. penggaris, Pensil, Spidol kecil,6. Printout tabel bahan simulasi sintesis protein (dari guru pembimbing)5. Langkah bahan Simulasi1) Membuat topi kerucut

a. Pertama menggunting kertas karton manila sesuai dengan pola bentuk topi kerucut sebanyak 4 buah.

Rantai anti sense : topi merah Rantai sense: topi kuning RNA ribosom:topi hijau RNA duta

: topi biru b. Bentuklah guntingan pola tersebut menjadi sebuah topi kerucut

c. Terakhir, mengelem bagian pinggir topi. Untuk merekatkan kertas agar tidak mudah lepas.2) Membuat papan kodon

a. Pertama, menggunting kertas karton manila putih sebesar kertas legal sebanyak 64 buah.

b. Menulis daftar kodon di kertas karton manila yang telah di gunting pada bagian depan dan asam aminonya pada bagian belakang dengan bersih dan teratur.

c. Menggunting benang wol sebanyak 64 buah dengan panjang masing masing benang wol yaitu 60 cm,

d. Mengikatkan benang wol yang telah di gunting pada bagian atas kertas karton yang sebelumnya telah dilubangi pada sisi kiri dan kanan bagian atas.

6. LANGKAH SIMULASI1. Pilihlah 4 orang siswa kelas XII IPA 5 yang akan ditunjuk menjadi DNA dan RNA :a. Rantai anti sense : topi merah >> berperan sebagai penerima awal kodon

b. Rantai sense: topi kuning >> berperan sebagai menerjemahkan kodon

c. RNA duta: topi biru >> berperan sebagai menerjemahkan kodon

d. RNA ribosom:topi hijau >> berperan sebagai menerjemahkan kodon dan memanggil RNA transfer.

2. Siswa lainnya menjadi RNA transfer, yang mengenakan papan kodon/asam amino,

3. Kemudian ikutilah instruksi dari Pembina.4. Setelah soal mengenai kode genetik diberikan kepada rantai antisense maka rantai sense akan menterjemahkan kode genetic yang di transfer oleh rantai antisense.

5. Siswa yang berperan sebagai Rantai sense mentransfer kode genetic ke RNA duta.6. Siswa yang berperan sebagai RNA duta menterjemahkan kode genetic dari rantai sense yang kemudian di transfer lagi menuju RNA ribosom.7. Siswa yang berperan sebagai RNA ribosom menterjemahkan kode genetic dari RNA duta dan memanggil RNA transfer sesuai dengan kodon yang telah diterjemahkan.

8. Siswa yang berperan sebagai RNA transfer akan datang memenuhi panggilan sesuai dengan urutan kodon yang diterjemahkan oleh RNA Ribosom. ( persyartan: sesuai aturan yang berlaku : jika yang dipanggil adalah kodon AAU maka yang akan datang adalah kodon UUA )

9. Setelah RNA transfer dipanggil dan berurutan dari kiri ke kanan kemudian masing masing RNA transfer berbaris membentuk suatu susunan yang teratur.

10. Setelah itu RNA transfer membalik papan kodon sehingga akan terbentuk suatu susunan kata ( misal : KUMAHA DAMANG) atau (JUST FOR FUNNY ). Susunan kata yang menjadi kalimat inilah yang di ibaratkan sebagai protein hasil proses sintesis protein dalam sel. (papan kodon yang memiki STOP atau START akan menjadi spasi pada susunan kalimat tersebut).Contoh Jalannya Proses Sintesis Protein RANTAI ANTISENSE

AAA TGT SSG

RANTAI SENSE

TTT ASA GGS

RNA DUTA

AAA UGU SSG

RNA RIBOSOM

UUU ASA GGS

RNA TRANSFER

AAA UGU SSG

DAFTAR KODON DAN ASAM AMINOBASA PERTAMABASA KEDUABASA KETIGA

USAG

KODONA. AMINOKODONA. AMINOKODONA. AMINOKODONA. AMINO

UUUUBUSUSUAUEUGUCU

UUSBUSSSUASEUGSCS

UUADUSAFUAASTOPUGASTOPA

UUGDUSGFUAGSTOPUGGUG

SSUULSSUPSAUHSGUKU

SUSLSSSPSASHSGSKS

SUALSSAPSAAJSGAMA

SUGLSSGPSAGJSGGMG

AAUUIASUTAAUNAGUQU

AUSIASSTAASNAGSQS

AUAIASATAAAOAGARA

AUGSTARTASGTAAGOAGGRG

GGUUVGSUAGAUWGGUGU

GUSVGSSAGASXGGSGS

GUAVGSAAGAAYGGAGA

GUGVGSGAGAGZGGGGG

7. DATA HASIL SIMULASIa) Soal 1 : membuat kalimat dari data kodon yang diberikan oleh Pembina/Guru. SGU TGG SGA GSS SAT GSA TGA TTA GSG SGG GSA AAS GGS

Sehingga akan menghasilkan asam amino yang menyerupai kalimat, yaitu

KUMAHA DAMANGRantai AntisenseRantai SenseRNA dutaRNA ribosomRNA transferAsam Amino

SGUGSTSGUGSASGUK

TGGASSUGGASSUGGU

SGAGSTSGAGSUSGAM

GSSSGGGSSSGGGSSA

SATGTASAUGUASAUH

GSASGTGSASGUGSAA

TGAASTUGAASUUGA

TTAAATUUAAAUUUAD

GSGSGSGSGSGSGSGA

SGGGSSSGGGSSSGGM

GSASGTGSASGUGSAA

AASTTGAASUUGAASN

GGSSSGGGSSSGGGSG

b) Soal 2 : membuat kalimat dari data kodon yang diberikan oleh Pembina/Guru. TTG AAG TGA GAA AAA TGG AUG SGA ATT USS TST TAG SGG TAT

Rantai AntisenseRantai SenseRNA dutaRNA ribosomRNA transferAsam Amino

TTGAASUUGAASUUGD

AAGTTSAAGUUSAAGO

TGAASTUGAASUUGA

GAASTTGAASUUGAAY

AAATTTAAAUUUAAAO

TGGASSUGGASSUGGU

AUGTASAUGUASAUG

SGAGSTSGAGSUSGAM

ATTAUUAUUUAAAUUI

USSAGGUSSAGGUSSS

TSTAGAUSUAGAUSUS

TAGATSUAGAUSUAG

SGGGSSSGGGSSSGGM

TATATAUAUAUAUAUE

Sehingga akan menghasilkan asam amino yang menyerupai kalimat, yaitu

DO YOU MISS ME

c) Membuat kalimat menggunakan kodon pada Rantai Antisense.Kalimat : LALA BAONG

Asam AminoRNA transferRNA ribosomRNA dutaRantai SenseRantai Antisense

LSUUGAASUUGAASTT

AGSUSGAGSUSGAGST

LSUSGAGSUSGAGSTS

AGSSSGGGSSSGGGSS

AUGUASAUGTASATG

BUUUAAAUUUAAATTT

AGSUSGAGSUSGAGST

OAAGUUSAAGTTSAAG

NAAUUUAAAUTTAAAT

GGGUSSAGGUSSAGGT

Dan setelah dilakukan percobaan atau simulasi akan menghasilkan susunan kodon pada Rantai Antisense sebagai berikut :

STT GST STS GSS STG TTT GST SSG SST GGT **( tapi dari hasil simulasi kelas yang kami lakukan terjadi mutasi/kekeliruan )

d) Soal 4 : membuat kalimat dari kodon yang diberikan oleh Pembina/ guru.

(Ket: dikarenakan kesalahan yang kami lakukan, Pak Iin selaku Pembina Simulasi memberikan tugas baru kepada kami untuk membuat kalimat dari kodon)

SAG TGG TST AST TAA TSA AAA AGA TAG TGA TGG AAS AAT GAARantai AntisenseRantai SenseRNA dutaRNA ribosomRNA transferAsam Amino

SAGGTSSAGGUSSAGJ

TGGASSUGGASSUGGU

TSTAGAUSUAGAUSUS

ASTTGAASUUGAASUT

TAAATTUAAAUUUAA

TSAAGTUSAAGUUSAF

AAATTTAAAUUUAAAO

AGATSTAGAUSUAGAR

TAGATSUAGAUSUAG

TGAAGTUSAAGUUSAF

TGGASSUGGASSUGGU

AASTTGAASUUGAASN

AATTTAAAUUUAAAUN

GAASTTGAASUUGAAY

Sehingga akan menghasilkan asam amino yang menyerupai kalimat, yaitu :

JUST FOR FUNNY8. KesimpulanDari simulasi yang kami lakukan. Dapat diketahui bahwa proses sintesis protein dimulai dari diterimanya kode genetic oleh Rantai antisense yang kemudian di transfer ke Rantai sense. Rantai sense akan menterjemahkannya kodon dari rantai antisense dan mentransfer lagi ke RNA duta dan menerjemahkan kodon dari Rantai sense, kemudian RNA duta mentransfer ke RNA ribosom dan RNA ribosom menterjemahkannya, dan akan dibantu oleh RNA transfer. RNA transfer akan datang dengan membawa asam amino yang sesuai dengan kodon yang diterjemahkan oleh RNA ribosom. Asam amino akan berjajar-jajar dalam urutan yang sesuai dengan kodenya. Dari hal ini akan terbentuk protein yang berfungsi sebagai enzim, dalam mengatur metabolisme sel dan reproduksi.

DNA

RNA

AAU

N

FRONT

BACK

ASAM AMINO

KODON

GAMBAR : PAPAN KODON

Simulasi BiologiPage 10