Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell...

14
Kuliah Bagian 2: Pemahaman Tentang Hidup dan kehidupan Relevansinya dengan Biokimia bidang Peternakan (the chemical basis of life) Pemahaman bentuk dan fungsi biologis mahluk hidup/individu (sel) dari sudut pandang kimia www.bankselgamet.com

Transcript of Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell...

Page 1: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Kuliah Bagian 2:

• Struktur dan Fungsi Sel

• Pemahaman Tentang Hidup dan kehidupan

• Relevansinya dengan Biokimia bidang Peternakan

• (the chemical basis of life)

Pemahaman bentuk dan fungsi biologismahluk hidup/individu (sel) dari sudut

pandang kimia

www.bankselgamet.com

Page 2: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Struktur kimia dan bentuk molekul biologi

Interaksi antar biomolekul

Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel

Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel

Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan pengkoordinasian aktifitasnya

Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi

informasi genetika

Hal-hal yang dipelajariUnsur kimia utama penyusun mahluk hidup adalah bahan minor penyusun kerak bumi (kandungan utama 47% O, 28% Si, 7.9% Al, 4.5% Fe, dan 3.5% Ca).

99% penyusun sel adalah H, O, N, dan C

Unsur Elektron bebas Jumlah Fraksi

H 1 2/3

O 2 1/4

N 3 1/70

C 4 1/10

www.bankselgamet.com

Page 3: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Organism, Organ, Cell

Manusia organ ( otak, mata, organ-organ pencernaan,paru, jantung, ginjal, organ-organ reproduksi, danlainnya)

Organ jaringan, selwww.bankselgamet.com

Page 4: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Eukaryotic cell (animal)

www.bankselgamet.com

Page 5: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Comparison of Procaryotic and Eucaryotic Organisms

Procaryotes Eucaryotes

Organisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals

Cell linear dim. 1-10 :m 10-100 :m

Metabolism anaerobic or aerobic aerobic or anaerobic

Organelles no nucleus, chloroplasts,

mitochondria, endoplasmic

reticulum, etc.

DNA circular, in cytoplasm very long linear molecules

bounded by nuclear envelope

RNA and protein RNA and protein synthesized

in same compartment

RNA synthesized in nucleus;

protein, in cytoplasm

Cytoplasm no cytoskeleton:

no cytoplasmic streaming, no

endocytosis, no exocytosis

cytoskeleton composed of protein

filaments; cytoplasmic streaming;

endocytosis and exocytosis

Cell division chromosomes pulled apart by

attachment to plasma membrane

chromosomes pulled apart by

cytoskeletal spindle apparatus

Cellular

organization

mainly unicellular mainly multicellular, with

differentiation of many cell

typesMolecular Biology of the Cell, 2nd Ed. www.bankselgamet.com

Page 6: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Di dalam sel ada :

organel (mitokhondria dll), : bagian kecil dalam sel

dengan fungsi khusus

supra molekul (ribosom, enzim), makromulekul (polisakarida, polipeptida),

building block (asam amino, glukosa, asam lemak,

deoksinukleotida, ribonukleotida dll) metabolit (asam piruvat, asam sitrat,

asetoasetil-KoA, asam urat dll). www.bankselgamet.com

Page 7: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

The ER modifies proteins, makes macromolecules, and transfers substances throughout the cell.

Ribosome translates mRNA into a polypeptide chain (e.g., a protein).

Mitochondrion manufactures adenosine triphosphate (ATP), which is used as a source of energy.

The Cell (Struktur dan Fungsi Sel)

• circa 100 trillion (1014) cells in a human organism• 200 different forms of cells

Nucleus only in eukaryotic cells. Contains most of the cell's genetic material.

Nukleus :Pusat kontrol selMengandung DNADikelilingi oleh membran/selubung nukleusMerupakan organel yang paling mudah terlihat dibawah mikroskop

www.bankselgamet.com

Page 8: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

PENGERTIAN METABOLISME

• Metabolisme adalah semua perubahan kimia dan energi yang terjadi di dalam jasad hidup atau karena kegiatan jasad hidup.

• Yang mengalami perubahan adalah substrat reaksi dan energi. Perubahan dikatalisis oleh enzim.

• Fungsi metabolisme adalah mengekstrak energi dari substrat atau sekelilingnya, menyimpannya dalam senyawa energi tinggi untuk melaksanakan aktivitas/fungsi kehidupan.

• Secara umum metabolisme mengandung arti pemecahan (katabolisme) dan pembentukan (sintesis/anabolisme).

MAKANAN DICERNA PRODUK CERNA

DISERAP DI MUKOSA INTESTINUM METABOLISME

HASILNYA : ENERGI ( untuk aktivitas)

DAN METABOLIT ( untuk eksresi)www.bankselgamet.com

Page 9: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

KATABOLISME : pemecahan enzimatikdari bahan-bahan yang bermolekulbesar (bahan makanan : karbohidrat, lemak dan protein) menjadi senyawabermolekul kecil/sederhana, seperti : glukosa, laktat, asetat, asam urat, amoniak, CO2 dan urea, sehinggaterbebaskan energi.

ANABOLISME : sintesis enzimatiksenyawa molekul besar dari senyawayang lebih sederhana, pada umumnyadiperlukan energi.

ISTILAH PENTINGPerlu memahami mekanisme

biomolekul membuat mahluk hidup menjadi hidup

www.bankselgamet.com

Page 10: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Biomolecules – Structure

• Building block

• Simple sugar

• Amino acid

• Nucleotide

• Fatty acid

• Macromolecule

• Polysaccharide

• Protein (peptide)

• RNA or DNA

• Lipid

Anabolic

Catabolic

www.bankselgamet.com

Page 11: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

(Fuels)

Exergonic Oxidation

Complex

Metabolites

Endergonic Reduction

Simpler

Metabolites

Biodegradation

Biosynthesis

Output of energy

Input of energy

www.bankselgamet.com

Page 12: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

Strategi sel 1. : menggunakan sistem reaksi

kimia berpasangan untuk mendorong reaksi yang

sulit terjadi

Strategi sel 2: mahlukhidup menggunakan

enzim untukmempercepat reaksi yang

semestinya lambat

STRATEGI MAKHLUK HIDUP

www.bankselgamet.com

Page 13: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

RINGKASAN METABOLISME

www.bankselgamet.com

Page 14: Kuliah Bagian 2 - · PDF fileOrganisms archaea, bacteria protists, fungi, plants, animals Cell linear dim. 1-10 : ... KATABOLISME : pemecahan enzimatik dari bahan-bahan yang bermolekul

KARTBOHIDRAT PROTEIN LEMAK

PENCERNAAN DAN ABSORBSI

MONOSAKARIDA

/TERUTAMA GLUKOSAASAM AMINO

ASAM LEMAK DAN GLISEROL

KATABOLISME ---------------------------

-----------------------------

ASETIL - koA

SIKLUS ASAM SITRAT

2H+

ATPCO2

LINTASAN KATABOLISME UNSUR MAKANAN

www.bankselgamet.com