Kekerabatan Antar Takson

8/16/2019 Kekerabatan Antar Takson

1/9

KEKERABATAN ANTAR TAKSONPendahuluan Tjitrosoepomo (1993) & Singh (1999) menjelaskan bahwa taksonomi

merupakan salah satu bidang biologi paling dasar dengan ruang lingkup yang

meliputi identifkasi, tatanama, deskripsi, klasifkasi dan flogeni !aik (199") &

Singh (1999) menyatakan bahwa klasifkasi merupakan pengelompokan

tanaman ke dalam kelompok tertentu baik ke dalam kelompok yang besar

ataupun yang lebih ke#il dengan dasar persamaan dan perbedaan si$at #iri

%roses ini di#apai dengan menyatukan golongan yang sama dan memisahkan

golongan yang berbeda

Taksonomi numerik merupakan ilmu pengetahuan yang bersi$at empirik,

ilmu tersebut berguna dalam menentukan kedudukan takson dan menyusun

klasifkasi yang berdasarkan hubungan kekerabatan $enetik melalui pelaksanaan

metodologi yang bertahap Taksonomi numerik didasarkan pada bukti $enetik

sebagai penilaian dari suatu $enotip organisme yang terbagi dalam suatu seri

langkah yang objekti$, jelas, tegas dan dapat diulang umlah karakter yang

digunakan dalam taksonomi numeri# masih belum ada ketentuan yang pasti

'da pendapat yang menyatakan bahwa sebaiknya tidak kurang dari

karakter, atau berkisar * + 1 karakter (Shukla & isra, 19-.)Shukla & isra (19-.) menggolongkan hubungan kekerabatan sebagai berikut /

1 0ubungan kekerabatan $enetik erupakan hubungan kekerabatan

yang berdasar pada kesamaan si$atsi$at prinsip (tampak) antara

indi2idu yang satu dengan yang lainnya. 0ubungan kekerabatan kladistik erupakan hubungan kekerabatan

antara indi2idu satu dengan yang lainnya dengan memperhatikan

sejarah e2ulosinya

3 0ubungan kekerabatan kronistik erupakan hubungan kekerabatan

antara bagianbagian dari unitunit taksonomi yang diukur berdasarkan

skala waktu e2olusi dikombinasikan dengan $enetik" 0ubungan kekerabatan flogenetik erupakan hubungan kekerabatan

antara indi2idu satu dengan lainnya berdasar pada sejarah asalusul

nenek moyangnya

Tumbuhan memiliki beragam si$at maupun #iri yang dapat diukur dan

digunakan sebagai dasar dari klasifkasi (a2is & 0eywood, 193) Sumber buktiyang digunakan dalam sistematik meliputi mor$ologi, anatomi, palinologi,


2/9

embriologi, sitologi, genetik, biologi reproduksi, kimia, ekologi dan geograf yang

disajikan sebagai sudut pandang atau bukti dalam menentukan defnisi dan si$at

(4ad$ord, 19-)

5angkah langkah dalam taksonomi numerik adalah6 1) pemilihan spe#imen,.) penentuan dan pengukuran karakter, 3) %emberian kode pada karakter, ")

perhitungan kesamaan antar karakter, *) pengelompokan, ) ekstraksi data tiap

takson

BAHAN:

Spesimen tumbuhan 1 enis

1 ar#hantia. 7ryum3 'diantum" 5y#opodium* %inus 8netum :aesalpinnia- 'llamanda9 5ilium1 'ra#hnis

%ersiapan6

1 :opy So$ware %'ST (%alaentologi#al Statisti#). Siapkan bahan;spe#imen (yang %ernah dipraktikumkan)

Cara Kerja Penentuan hubungan kekerabatan dengan bantuan PAS

1 %enentuan Satuan Taksonomi


3/9

3 %emberian kode pada si$at

7erilah kode pada si$atsi$at yang diamati (1,.,3 dst)

" %enghitungan kesamaan antar takson dan pengelompokan di lakukan

dengan bantuan so$tware %'ST

5angkahlangkah %enghitungan kesamaan antar takson dan pengelompokan di

lakukan dengan bantuan so$twarer %'ST adalah sebagai berikut6

1 %ersiapkan tabel si$at ke dalam fle e@#el. 7uka A@#ell, ketik si$at #iri dan mana jenis3 5akukan karakterisasi terhadap jenis yang diamati, berikan pembobotan

si$at #irinya, jika ada beri bobot 1, jika tidak ada beri bobot

!o Si$at

Spesies

1 . 3 " * - 9 1

1.3"*-9

1111.13

st

:ontoh 1 Tabel si$at #iri

ar#h

7ryum 'dia

5y#op %inus

8netum

:aesalp 'llam

5ilium


4/9

Tumbuhanber2askuler 1 1 1 1 1 1 1 1

Tumbuhanberstrobilus 1 1 1

Tumbuhan

berbunga 1 1 1 1 Tumbuhanberdaunmikrofl 1 1 7erdaunmakrofl 1 1 1 1 1 1 17erdaunsporofl 1 1 7erdauntropofl 1 1 1 1 1 1 1 1

Tumbuhanhomospora 1 1 1

Tumbuhanheterospora 1 7ungapentamer 1 1

7unga trimer 1 1 17akal buah dilindungikarpela 1 1 1 17akal buahtidak adakarpella 1 1

%erhiasanbunga berupatenda bunga 1 1%erhiasabunga berupasepata danpetala 1 1 %erhiasanbungamidifkasimenjadilbelum 18ametoftdominan 1 1 Sporoftdominan 1 1 1 1 1 1 1 1

. 7uka program %'S

•

:opy kan data A@ell ke %'ST• :opykan dulu 7obot (skor)


5/9

• :opy label dengan mengakti$kan edit label

• 5akukan transpose data

• =ntuk membuat dendogram kekekerabatan

• 7lok data

•

%ilih ulti2ariat• %ilih :luster 'nalisis

• Sa2e gambar dendogram

3 =ntuk melihat >ndeks Similaritas

• %ilih Similarity and istan#e >ndi#e

• =ntuk melihat #ladistiknya;Bilogeni

• %ilih :ladisti#

• Tekan %arsimony

•

%ilih 8o

M a r c h a n

t i

B r y u m

A d i a n t u m

P i n u s_

G n e t u m

C a e s a l p i n

A l l a m a n d a

L i l i u m

O r c h i d

L y c o p o d

i u

" >nteprestasikan data jauh dekatnya hubungan kekerabatan antar kelompok

takson berdasarkan gambar dendogram, similaritas, dan jarak taksonomi

* 7uatlah kun#i determinasi


6/9

Tabel Similaritas atau jarak taksonomi

Sp 1 Sp 2 Sp 3 Sp 4 Sp 5 Sp 6 Sp 7 Sp 8 Sp 9 Sp 10Sp

11

Sp

12

Sp

13

Sp

14

Sp 11.00

0

Sp 20.94

2

1.00

0

Sp 30.46

1

0.43

0

1.00

0

Sp 40.62

8

0.65

7

0.46

1

1.00

0

Sp 50.61

9

0.61

9

0.45

4

0.84

5

1.00

0

Sp 60.56

3

0.61

9

0.42

4

0.81

6

0.83

3

1.00

0

Sp 70.53

5

0.56

3

0.42

4

0.84

5

0.77

7

0.77

7

1.00

0

Sp 80.59

1

0.61

9

0.42

4

0.84

5

0.80

5

0.86

1

0.80

5

1.00

0

Sp 90.58

30.611

0.59

70.611

0.60

2

0.54

7

0.49

3

0.52

0

1.00

0

Sp 100.60

2

0.63

0

0.67

6

0.57

5

0.64

8

0.54

0

0.54

0

0.56

7

0.82

61.000

Sp 110.54

7

0.54

7

0.61

7

0.52

0

0.59

4

0.54

0

0.45

9

0.54

0

0.74

60.842

1.00

0

Sp 120.50

0

0.50

0

0.44

7

0.55

5

0.63

0

0.63

0

0.60

2

0.63

0

0.48

60.613

0.64

0

1.00

0

Sp 130.58

3

0.55

5

0.44

7

0.58

3

0.63

0

0.63

0

0.60

2

0.54

7

0.54

00.586

0.61

3

0.86

4

1.00

0

Sp 14

0.52

7

0.52

7

0.47

7

0.63

8

0.63

0

0.63

0

0.63

0

0.54

7

0.54

0

0.586

6

0.61

3

0.86

4

0.91

8

1.00

0


7/9

Berdasarkan asil dari sumber bukti anatomi !an" diamati terliat terjadi pen"elompokkan

pada ke 14 spesies tersebut sesuai den"an "enusn!a. #enus tersebut adala Zingiber, Curcuma,

Kaempferia, Amomum, Alpinia, dan Costus. $en"elompokkan ini membuktikan ba%a sumber bukti

anatomi mampu meperliatkan adan!a ubun"an kekerabatan !an" jelas dari &in"ibera'eae.

(ubun"an kekerabatan pada jarak terdekat den"an indeks similaritas 0.94 terdapat pada spesies

Amomum compactum dan Alpinia galanga) serta ubun"an kekerabatan terjau den"an indeks

similaritas 0.42 terdapat pada spesies Costus speciosus den"an Curcuma heyneana) Curcuma

mangga) dan Curcuma xanthorrhiza selen"kapn!a *ampiran 4.

+endo"ram dibuat berdasarkan si,at anatomi den"an jumla keseluruan si,at !an" diamati

seban!ak 90 si,at. Berdasarkan dendo"ram -#ambar 4.9 terliat ada 2 kelompok besar dari

spesimen !an" diamati !aitu kelompok / dan kelompok B) den"an indeks similaritas 0.54.

elompok / terdiri dari "enus Amomum, Alpinia, Curcuma, Zingiber dan kelompok B terdiri dari

Costus, Kaempferia.

elompok / terdiri dari 2 subkluster !aitu a1 dan a2) kedua subkluster ini mempun!ai indeks

similaritas 0.58. Subkluster a1 terdiri dari "enus Alpinia - A. galanga dan Amomum - A. compactum)

kedua spesies mempun!ai indeks similaritas 0.94. A. galanga dan A. compactum mempun!ai

kemiripan anatomi !aitu bentuk) ukuran dan jumla epidermis) tebal palisade !an" sama)

mempun!ai kelenjar min!ak pada daun) tipe) jumla dan bentuk stomata !an" sama) serta jumla

dan ukuran idioblasn!a. Berdasarkan sistem /$# kedua spesies ini termasuk ke dalam anak suku

/lpinioideae den"an tribus /lpinieae. Se'ara mor,olo"i A. galanga dan A. compactum mempun!ai

kemiripan !an" tin""i.

Subkluster a2 terba"i menjadi 2 subsubkluster !aitu a3 dan a4) kedua subsubkluster ini

mempun!ai indeks similaritas 0.61. Subsubkluster a3 adala "enus Curcuma -C. aeruginosa, C.

longa, C. heyneana, C. mangga, dan C. xanthorrhiza. Berdasarkan asil dendo"ram kelima spesies

mempun!ai indeks similaritas 0.81. ndeks similaritas tertin""i terdapat pada C. heyneana dan C.


8/9

xanthorrhiza den"an indeks similaritas 0.85) keduann!a mempun!ai kemiripan pada jumla stomata

dan ukuran sel idioblas. C. aeruginosa dan C. mangga mempun!ai indeks similaritas 0.86) kemiripan

kedua spesies ini terdapat pada lapisan peridaerm serta ukuran sel idioblas. Curcuma longa

mempun!ai indeks similaritas 0.82 ber"abun" den"an C. aeruginosa dan C. mangga.

Subsubkluster a4 terdiri dari spesies Z. amaricans, Z. cassumunar, Z. officinale !an"

merupakan "enus Zingiber . Berdasarkan asil dendo"ram keti"a spesies mempun!ai nilai indeks

similaritas 0.86. Z. amaricans, Z. cassumunar, Z. officinale mempun!ai kemiripan si,at anatomi

berupa ketebalan epidermis daun) adan!a kristal aoksalat dan bentuk !an" sama) tebal palisade)

si,at) tipe dan bentuk stomata !an" ampir sama) bentuk) ukuran) jumla epidermis dan ukuran sel

idioblas daun !an" ampir sama. Z. cassumunar dan Z. officinale mempun!ai nilai indeks similaritas

0.91) keduan!a mempun!ai kemiripan pada jumla stomata epidermis atas serta bentuk sel

epidermis. Z. amaricans terpisa dari dua kerabatn!a Z. cassumunar dan Z. officinale) tetapi keti"a

spesies bertemu pada nilai indeks similaritas 0.86.

elompok B terdiri dari 2 subkluster !aitu b1 den"an "enus Costus dan b2 den"an "enus

Kaempferia) 2 subkluster tersebut mempun!ai indeks similaritas 0.63. Subkluster b1 den"an spesies

C. speciosus mempun!ai indeks similaritas 0.63) berdasarkan dendo"ram -#ambar 4.9 C. speciosus

merupakan ba"ian dari &in"ibera'eae den"an men""unakan sumber bukti anatomi) al ini sesuai

den"an pendapat *a%ran'e -1968 !an" memasukkan C. speciosus ke dalam ,amili &in"ibera'eae

den"an men""unakan sumber bukti mor,olo"i. $enambaan si,atsi,at anatomi !an" lebi kompleks

memun"kinkan C. speciosus dapat memisa dari &in"ibera'eae) seperti pendapat dari ronuist

-1981 !an" memasukkan C. speciosus ke dalam osta'eae dan memisakann!a dari &in"ibera'eae

den"an men""unakan sumber bukti mor,olo"i dan kromosom.

Subkluster b2 terdiri dari spesies K. pandurata, K. galanga dan K. rotunda mempun!ai indek

similaritas 0.79. K. galanga terpisa dari K. pandurata dan K. rotunda tetapi keti"a spesies ini

berada pada indeks similaritas 0.79. K. pandurata dan K. rotunda mempun!ai indeks similaritas


9/9

0.84. K. pandurata dan K. rotunda mempun!ai kemiripan si,at anatomi !aitu ketebalan epidermis

daun) letak stomata dan tebal lapisan periderm -*ampiran 4.

!o Carakter Sp1 Sp. Sp3 Sp"1 aun

a %anjang tangkai pendek pendek panjang panjangb Tipe daun tunggal tunggal majemuk majemuk# Tepi daun rata berlekuk rata bergigid %anjang daune 5ebar daun$ 4atio panjang6lebarg Darna permukaan

atash Darna permukaan

bawah

Kekerabatan Antar Takson

Documents

Transcript of Kekerabatan Antar Takson