ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA...

18
ISOLASI DAN TERHADAP DI RUMAH SA UNIVERSITA N IDENTIFIKASI BAKTERI RESIST P ANTIBIOTIK DARI SAMPEL TANA AKIT WIJAYAKUSUMA PURWOKE LISNA YULIANIS 0808010093 FAKULTAS FARMASI AS MUHAMMADIYAH PURWOKER PURWOKERTO 2012 TEN AH ERTO RTO

Transcript of ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA...

Page 1: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN TERHADAP ANTIBIOTIK DARI SAMPEL TANAH

DI RUMAH SAKIT WIJAYAKUSUMA PURWOKERTO

UNIVERSITAS

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN TERHADAP ANTIBIOTIK DARI SAMPEL TANAH

DI RUMAH SAKIT WIJAYAKUSUMA PURWOKERTO

LISNA YULIANIS0808010093

FAKULTAS FARMASIUNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

PURWOKERTO2012

1

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN TERHADAP ANTIBIOTIK DARI SAMPEL TANAH

DI RUMAH SAKIT WIJAYAKUSUMA PURWOKERTO

MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

Page 2: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

3

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 3: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

4

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 4: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

5

PERNYATAAN

Yang bertanda tangan dibawah ini, saya :

Nama : Lisna Yulianis

NIM : 0808010093

Program studi : Farmasi

Fakultas / Universitas : Farmasi / Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Menyatakan dengan sebenar-benarnya bahwa skripsi ini adalah hasil dari proses

penelitian saya yang telah dilakukan sesuai dengan prosedur penelitian yang benar

dengan arahan dari dosen pembimbing dan bukan hasil penjiplakan dari karya

orang lain atau terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar

kesarjanaan di suatu perguruan tinggi, dan sepanjang pengetahuan penulis juga

tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan orang lain

kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar

pustaka.

Demikian pernyataan ini, dan apabila kelak dikemudian hari terbukti ada

unsur penjiplakan maka saya bersedia mempertanggung jawabkan sesuai dengan

ketentuan yang berlaku.

Purwokerto, Agustus 2012

Yang menyatakan,

Lisna Yulianis

iv

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 5: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

6

INTISARI

LISNA YULIANIS. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Resisten terhadap Antibiotik dari Sampel Tanah di Rumah Sakit Wijayakusuma Purwokerto.

Dibawah bimbingan BINAR ASRINING DHIANI dan RETNO WAHYUNINGRUM

Latar Belakang: Di lingkungan rumah sakit terdapat bakteri yang hidup dan berkembang pada udara, air, tanah, lantai, makanan dan benda-benda medis maupun non medis. Bakteri-bakteri tersebut dapat menyebabkan infeksi nosokomial yaitu infeksi yang terjadi dan diperoleh penderita selama dirawat di rumah sakit. Penyakit infeksi tersebut dapat diatasi dengan antibiotik tetapi sering terkendala oleh adanya faktor resistensi bakteri terhadap antibiotik yang telah ada.

Tujuan Penelitian: Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi bakteri yang berasal dari sampel tanah di Rumah Sakit Wijayakusuma dan mengidentifikasi resistensi bakteri hasil isolasi terhadap beberapa antibiotik serta mengidentifikasi jenis bakteri berdasarkan pengecatan Gram dan identifikasi biokimia.

Metode Penelitian: Jenis penelitian ini adalah non eksperimental deskriptif. Uji resistensi bakteri menggunakan Metode disc diffusion (tes Kirby & Bauer). Antibiotik yang digunakan yaitu amoksisillin, kloramfenikol, siprofloksasin, gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia yaitu uji oksidase, uji katalase, uji fermentasi karbohidrat, uji methyl red, uji voges proskauer.

Hasil: Hasil isolasi bakteri yang diperoleh sebanyak 94 bakteri. Berdasarkan pengamatan makroskopis pada masing-masing biakan diperoleh hasil bahwa semua koloni mempunyai bentuk koloni bulat, elevasi koloni rata, struktur permukaan koloni halus dan koloni berwarna putih. Dari total isolat bakteri sebanyak 94, terdapat 54 bakteri yang resisten terhadap satu antibiotik dan terdapat 10 bakteri yang resisten terhadap dua antibiotik. Berdasarkan hasil pewarnaan bakteri dari 64 jumlah bakteri yang resisten terdapat 52 bakteri Gram positif dan 12 bakteri Gram negatif. Bakteri hasil identifikasi yang resisten terhadap 2 antibiotik terdapat 10 bakteri yaitu bakteri WK-5, WK-26, WK-80 dan WK-49 termasuk dalam genus Bacillus. Bakteri WK-76 dan WK-84 termasuk dalam famili Enterobacter. Bakteri WK-9, WK-45 dan WK-91 termasuk dalam genus Streptococcus. Bakteri WK-74 termasuk dalam genus Micrococcus.

Kesimpulan: Dari sampel tanah di rumah sakit Wijayakusuma Purwokerto diperoleh 94 bakteri yang dominan, 64 bakteri resisten terhadap antibiotik, 52 termasuk bakteri Gram positif dan 12 bakteri gram negatif. Dari 10 bakteri yang resisten terhadap 2 antibiotik, kemungkinan terdapat beberapa jenis bakteri dari genus Bacillus, Sterptococcus, Enterobacter dan Micrococcus.

v

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 6: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

7

Kata Kunci: isolasi dan identifikasi bakteri, bakteri resisten, antibiotik, sampel tanah, Rumah Sakit Wijayakusuma Purwokerto.

vi

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 7: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

8

ABSTRACT

LISNA YULIANIS. Isolation and Identification of Antibiotic Bacteria Resistant from Soil Samples in Wijayakusuma Hospital.

Under Supervision of BINAR ASRINING DHIANI and RETNO WAHYUNINGRUM

Background: In the hospital environment there are bacteria that live in the air, water, soil, floor, food, medical and non-medical apparatus. This bacteria can cause nosocomial infections which acquired and obtained during hospitalization. Infectious diseases can be treated by antibiotics but it often problem by caused by this bacterial resistant to antibiotics.

Objetive: The purpose of research was to isolate bacteria from soil samples onHospital Wijayakusuma and identified the resistance of bacteria isolate of bacteria isolate toward some antibiotics as well as identified the family of bacteria based on Gram staining and biochemical characteristic.

Methods: The method of this research was descriptive non-experimental.Bacterial resistance test used the disc diffusion method (Kirby & Bauer test). Antibiotic which was used were amoxicillin, chloramphenicol, ciprofloxacin, gentamicin and oxytetracycline. Identification bacteria with biochemical test used oxidase test, catalase test, carbohydrate fermentation test, methyl red test and Voges proskauer test.

Result : The research was succeded to isolate 94 bacteria. Based on macroscopicobservations of each culture showed that all colonies morphology was round, average elevation showed smooth surface structure and white color colonies.From the total of 94 bacteria, there were 54 bacteria resistant to one antibiotic, and there were 10 bacteria resistant to two antibiotics: amoxicillin andchloramphenicol. Based on the staining of bacteria from 64 resistant bacteria there were 52 bacteria Gram positive and 12 bacteria Gram negative. Identification ofbacteria resistant exhibited that bacteria WK-5, WK-26, WK-80 and WK-49belonged to the genus Bacillus. Bacteria WK-76 and WK-84 belonged to the family Enterobacter. Bacteria-9 WK, WK-45 and WK-91 belonged to the genus Streptococcus. WK-74 bacteria belonged to the genus Micrococcus.

Conclusion:. From soil samples at hospital Wijayakusuma was isolated 94, 64 bacteria resistant to antibiotics, 52 bacteria Gram positive and 12 bacteria Gram negative. From the 10 bacteria which were resistant to two antibiotics, it suggested that some isolate of bacteria belonged to genus Bacillus, Sterptococcus, Enterobacter and Micrococcus.

vii

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 8: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

9

Keyword : isolation and identification of bacteria, resistant bacteria, antibiotics, soil samples, Wijayakusuma Hospital Purwokerto.

viii

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 9: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

10

PERSEMBAHAN

Skripsi ini kupersembahkan untuk.......

APA n’ MAMAH yang senantiasa mencurahkan kasih sayang dan untaian doa yang tiada henti serta pengorbanan yang tak terbatas dan tak terbalas.

Kedua kakaku (teh aas n’ teh nita) serta adeku (de ibang) yang selalu memberikan doa n’ semangatnya.

Keluarga besar wisma jayanti, moel, mono, t’fuji, vita, inul, tante, mb nita, mb nurul, dini, wiwi makasih buat kebersamaan, kekeluargaan, bantuan n’ semangatnya. Buat bunda, pak mico, kakak gina n’ babay terimakasih atas persaudaraannya selama ini. Semoga tali silaturahmi kita tetap terjaga.

Teman-teman farmasi angkatan 2008 makasih banyak buat kebersamaan serta semangatnya.

Belahan jiwaku, seseorang yang akan mengisi hari-hariku danmenemaniku, yang masih menjadi rahasia Allah SWT.

ix

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 10: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

11

MOTTO

Usaha, do’a, ikhlas, sabar…

Waktu yang tlah berlalu takkan bisa terulang, so…lakukanlah

yang terbaik…

“Sesungguhnya Allah tidak akan mengubah nasib suatu kaum

kecuali kaum itu sendiri yang mengubah apa apa yang pada

diri mereka” (QS Ar-Rad: 11)

x

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 11: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

12

KATA PENGANTAR

Alhamdulillahhirobbil’alamin, puji syukur dan terimakasih penulis

panjatkan kehadirat Allah SWT, Yang Maha Pengasih dan Penyayang, yang telah

melimpahkan rahmat dan hidayah-Nya sehingga penulis mampu menyelesaikan

skripsi ini yang berjudul “ Isolasi dan Identifikasi Bakteri Resisten Terhadap

Antibiotik Dari Sampel Tanah Di Rumah Sakit Wijayakusuma Purwokerto”.

Skripsi ini disusun sebagai salah satu syarat untuk mencapai gelar Sarjana

Farmasi di Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

Penulis sepenuhnya menyadari bahwasannya terselesaikannya skripsi ini

tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karena itu penulis ingin

mengucapkan rasa terimakasih kepada:

1. Bapak Dr. Syamsuhadi Irsyad, S.H.,M.H. selaku Rektor Universitas

Muhammadiyah Purwokerto.

2. Bapak Drs. Moeslich Hasanmihardja, Apt. selaku Dekan Fakultas Farmasi

Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

3. Bapak dan Ibu Dosen Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah

Purwokerto yang telah memberikan ilmunya.

4. Laboran Mikrobiologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

5. Segenap Staf dan karyawan Tata Usaha Universitas Muhammadiyah

Purwokerto.

6. Kedua orang tua terima kasih atas doa dan dukungannya sampai selesainya

skripsi ini.

7. Dinar, handri, moel, inul terima kasih atas segala bantuan dan dukungan

selama penelitian.

8. Sahabat-sahabatku, terima kasih atas dukungan, kebersamaan dan canda tawa

yang kalian berikan selama ini.

9. Teman-teman Farmasi angkatan 2008 terima kasih atas kebersamaan dan

kekeluargaan yang kalian berikan selama ini.

10. Teman-teman kosan yang selalu ada dalam suka dukaku dan terimakasih atas

kebersamaannya.

xi

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 12: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

13

11. Kakak angkatan yang telah memberikan arahan kepada saya.

12. Semua pihak yang telah membantu hingga selesainya skripsi ini.

Dalam penyusunan skripsi ini penulis menyadari masih terdapat banyak

kekurangan, untuk itu penulis mohon maaf. Saran dan kritik yang bersifat

membangun sangat penulis harapkan demi penyempurnaan skripsi ini. Sebagai

kata penutup, penulis berharap semoga penelitian ini dapat memberikan manfaat

bagi penulis pada khususnya dan bagi pembaca pada umumnya.

Purwokerto, Agustus 2012

Lisna Yulianis

xii

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 13: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

14

DAFTAR ISI

Halaman

HALAMAN JUDUL .................................................................................. i

HALAMAN PERSETUJUAN .................................................................... ii

HALAMAN PENGESAHAN ......................................................................... iii

PERNYATAAN .......................................................................................... iv

INTISARI ....................................................................................................... v

ABSTRACT ...................................................................................................... vii

PERSEMBAHAN ....................................................................................... ix

MOTTO ...................................................................................................... x

KATA PENGANTAR ................................................................................ xi

DAFTAR ISI .............................................................................................. xiii

DAFTAR TABEL ...................................................................................... xv

DAFTAR GAMBAR .................................................................................. xvi

DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................... xvii

BAB I. PENDAHULUAN .......................................................................... 1

A. Latar Belakang ........................................................................... 1

B. Perumusan Masalah ...................................................................... 2

B. Tujuan Penelitian ......................................................................... 2

C. Manfaat Penelitian ........................................................................ 2

BAB II. TINJAUAN PUSTAKA ................................................................ 3

xiii

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 14: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

15

A. Bakteri ........................................................................................ 3

B. Isolasi Bakteri ............................................................................. 4

C. Identifikasi Bakteri ..................................................................... 5

D. Antibiotika ................................................................................. 6

E. Uji Antibiotika ............................................................................ 8

BAB III. METODE PENELITIAN .......................................................... 10

A. Jenis dan Rancangan Penelitian....................................................... 10

B. Alat dan Bahan............................................................................ 10

C. Cara Penelitian ............................................................................ 11

1. Tahap Persiapan..................................................................... 11

a. Pengambilan Sampel ......................................................... 11

b. Sterilisasi Alat dan Bahan.................................................. 11

c. Pembuatan Medium Nutrient Agar .................................... 11

d. Isolasi bakteri .................................................................... 12

e. Perkiraan Jumlah Sel dan Stok Kultur................................ 12

2. Tahap Pelaksanaan................................................................. 13

a. Uji Resistensi Antibiotik.................................................... 13

b. Pewarnaan Gram Bakteri ................................................... 14

3. Identifikasi Bakteri ................................................................ 14

a. Pembuatan Medium........................................................... 14

b. Uji Biokimia...................................................................... 15

BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................. 18

A. Isolasi Bakteri.............................................................................. 18

B. Uji Resistensi Terhadap Antibiotik .............................................. 19

C. Pewarnaan Gram Bakteri ............................................................. 23

D. Uji biokimia ................................................................................ 24

E. Identifikasi Bakteri......................................................................... 27

BAB V. KESIMPULAN DAN SARAN ...................................................... 28

A. Kesimpulan ................................................................................ 28

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 15: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

16

B. Saran........................................................................................... 28

DAFTAR PUSTAKA.................................................................................. 29

LAMPIRAN..................................................................................................... 31

xiv

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 16: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

17

DAFTAR TABEL

Halaman

1. Interprestasi zona hambat kirby-bauer terhadap pengujian antibiotik ..... 13

2. Hasil uji biokimia ................................................................................. 40

xv

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 17: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

18

DAFTAR GAMBAR

Halaman

1. Hasil isolasi awal dari sampel tanah pada pengenceran 10-5………………… 18

2. Hasil pemurnian dari isolat bakteri WK-90 ..................................................... 19

3. Hasil uji resistensi terhadap antibiotik ………………………………………. 19

4. Pewarnaan Gram bakteri pada bakteri WK-2 dan WK-8 ……………………. 24

xvi

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012

Page 18: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RESISTEN ...repository.ump.ac.id/7220/1/COVER_LISNA YULIANIS_FARMASI...gentamisin dan oksitetrasiklin. Uji identifikasi bakteri menggunakan uji biokimia

19

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman

1. Gambar isolat bakteri .......................................................................... 32

2. Tabel hasil absorbansi .......................................................................... 32

3. Gambar hasil uji resistensi .................................................................. 34

4. Tabel hasil uji resistensi ....................................................................... 35

5. Gambar pewarnaan Gram bakteri ........................................................ 37

6. Tabel pewarnaan Gram bakteri............................................................. 38

7. Gambar hasil uji biokimia ................................................................... 39

8. Tabel Hasil uji biokimia ...................................................................... 40

9. Surat Permohonan Ijin Pengambilan Sampel ....................................... 41

10. Surat Balasan Ijin Penelitian .............................................................. 42

xvii

Isolasi Dan Identifikasi…, Lisna Yulianis, Fakultas Farmasi UMP, 2012