IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN...

13
IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN DI BALAI PERBIBITAN DAN PENGEMBANGAN INSEMINASI BUATAN TERNAK SAPI POTONG CIAMIS Cece Sumantri dan Team Fakultas Peternakan Institut Pertanian Bogor

Transcript of IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN...

Page 1: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN DI BALAI PERBIBITAN DAN

PENGEMBANGAN INSEMINASI BUATAN TERNAK SAPI POTONG CIAMIS

Cece Sumantri dan Team

Fakultas Peternakan

Institut Pertanian Bogor

Page 2: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

* Merupakan penyakit genetik pada sapi yang diakibatkan adanya mutasi titik basa G ke T pada posisi nukleotida 559 pada gen Solut Carrier Family 35 Member 3 (SLC35A3) * Menyebabkan kelainan pada tulang belakang bengkok (tulang punggung ruas 6 dan 7 bergabung) * Sindrom genetik ini pada sapi dalam keadaan homozigot resesif bersifat lethal atau mati dini.

Page 3: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Deteksi Penyakit FXID dan CVM pada Sapi Bali

Gambar 13. Hasil PCR-RFLP gen FXID (1-3)

dan CVM (4-6)

Tidak ditemukan sapi bali pembawa penyakit FXID dan CVM di (BPTU-

HMT Denpasar, BPT-HPT Serading NTB, VBC Kab. Barru Sulawesi

Selatan, BIB Singosari dan BIBD Baturiti)

Page 4: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Deteksi Penyakit CVM pada Sapi Pasundan

•. Gambar 2. Hasil PCR-RFLP gen SLC35A3 untuk Pendeteksian Complex Vertebral Malformation (CVM). M: Marker (DNA

Ladder) 100 bp, 1-9: sampel

Hasil menunjukkan pada sapi pasundan tidak ditemukan individu pembawa gen CVM

Page 5: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Kejadian CVM pada Beberapa Rumpun Sapi

Bangsa sapi sampel Frekuensi (%) Peneliti

FH (China) 670 292 (43,58) Chu et al (2008)

FH (Swedia) 228 58 (23,18) Berghund et al (2004)

Bali 325 0 (0,00) Siswanti et al (2014)

Pasundan 53 0 (0,00) Unpublish (2016)

Page 6: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Penyebab terjadinya FX1 Deficiency (FX1D)

* Merupakan penyakit genetik pada sapi yang diakibatkan adanya mutasi titik gen FX1 exon 12, menyebabkan terjadinya insersi/penambahan 76 basa pada polyadenin mengakibatkan proses stop kodon terganggu. * * Sindrom genetik ini pada sapi dalam keadaan homozigot resesif bersifat lethal atau mati dini.

Page 7: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Deteksi Penyakit FXID pada Sapi Pasundan

Gambar 1. Hasil PCR gen FXI untuk Pendeteksian Factor XI-Deficiency (FXID). M: Marker (DNA Ladder) 100 bp, 1-7: sampel

Hasil menunjukkan pada sapi pasundan tidak ditemukan individu pembawa gen FX!D

Page 8: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Kejadian FX1D pada Beberapa Rumpun Sapi

Bangsa sapi sampel Frekuensi (%) Peneliti

FH 103 5 (2,91) Gurgul et al (2009)

J.Black 123 47 (47,2) Ohba et al (2008)

Bali 325 0 (0,00) Siswanti et al (2014)

Pasundan 53 0 (0,00) Unpublish (2016)

Page 9: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Penyebab terjadinya Bovine leucocyte adhesion deficiency (BLAD)

* Merupakan sindrom granulositopati adalah penyakit genetik pada sapi yang disebabkan oleh tidak terekspresinya (defisiensi) molekul heterodimer β2 integrin yang seharusnya ada di permukaan neutrofil. Yang diakibatkan adanya mutasi titik pada ekson 2 gen CD18. * Integrin adalah molekul adhesi yang terlibat dalam mekanisme diapedesis neutrophil keluar dari pembuluh darah ke dalam jaringan untuk membunuh patogen yang masuk ke dalam tubuh (SHUSTER et al., 1992). * Sindrom genetik ini pada sapi dalam keadaan homozigot resesif bersifat lethal atau mati dini.

Page 10: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Deteksi Penyakit BLAD pada Sapi Pasundan

•Gambar 3. Hasil PCR-RFLP gen CD18 untuk Pendeteksian Bovine Leucosite Adhesion

Deficiency (BLAD). M: Marker (DNA Ladder) 20 bp, 1-8: sampel

Hasil menunjukkan pada sapi pasundan tidak ditemukan individu pembawa gen BLAD

Page 11: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Kejadian BLAD pada sapi di beberapa negara

Lokasi Jumlah sampel Frekuensi (%) Peneliti

Indonesia (Baturadden thn 2000)

81 2,4 Farajallah et al (2007)

India 711 3,33 Patel et al (2007)

Turki 120 1,67 Akyuz dan Erturul (2006)

Iran 30 3,33 Norouzy et al (2005_

Jepang Indonesia (BPPT SP Ciamis)*

796 53

8,79 0,00

Nagahata et al (1996) Unpublish (2016)

Page 12: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Contoh hasil tabulasi analisis Gen FXID, CVM dan BLAD pada Sapi Pasundan

Page 13: IDENTIFIKASI GEN CACAT GENETIS PADA SAPI PASUNDAN …dkpp.jabarprov.go.id/wp-content/uploads/2018/05/Identifikasi-cacat... · Penyebab terjadinya Complex Veterbral Malformation (CVM)

Terima kasih