GASTROINTESTINAL TRAC INFECTIONJEKTI T. ROCHANIBAGIAN MIKROBIOLOGI

PENDAHULUANPatogen yg tertelan dpt sbk penyakit infeksi pada sal cerna termsk bagian2 lain tubuhYg dibahas al mikroorganisme (bakteri,virus, jamur) penyebab diare, dan yg berhubungan dgn gangguan sal cerna, termasuk keracunan makanan, dll, juga organ yg terkait dgn GIT (hepar)Infeksi yg berhub dgn komsumsi makanan tercemar srg dis food-poisoning tetapi lbh tepat dis food-associated infection krn food-poisoning lbh tepat digunakan utk keracunan toksin bukan infeksi

Gejala paling sering akibat infeksi bakteri dan virus pd sal cerna adalah diareDi negara berkembang, diare mrpk penyebab kematian terbsr pd anak

Istilah pentingGastroenteritisDiareDisentriEnterokolitis

Bakteri dan virus penting penyebab infeksi GIT

Bakteri E. coli, Salmonella, Campylobacter, Vibrio cholerae, Shigella, Clostridium perfringens, Bacillus cereus, Vibrio parahaemolyticus, Yersinia entero-colitica

Virus rotavirus, norovirus (SRSV atau Norwalk-like virus)

BAKTERI PENYEBAB DIAREEscherichia coliFlora normal pada usus manusia & hewanBatang Gram negatif, gerak + (flagel peritrich)Manifestasi klinis:Septikemia: asal infeksi adalah infeksi saluran kemih atau penjalaran kuman dari ususInfeksi saluran kemih: penyebab 80% kasus; kuman hemolisin (+), tahan serum, faktor virulensi pili PMeningitis pada neonatus: E. coli K1Gastroenteritis (Diare) karena E. coli

Mekanisme virulensi E. coli

Patogenesis Diare akibat E. coli

ETEC (enterotoxigenic E. coli)

penyebab diare pada bayi, traveler's diarrheamasa inkubasi 1-2 hari, berlangsung 3-4 hariToksin LT (subunit A dan B) cAMP hipersekresi air dan Cl serta menghambat reabsorpsi Na+ diare. Bersifat antigenik dan serupa dengan enterotoksin V. cholerae.Toksin ST: aktifitas guanil siklase sekresi airkuman mempunyai faktor kolonisasi

EPEC (enteropathogenic E. coli)Penyebab diare (air) pada anak di negara berkembang, akut atau kronisMikrovili rusak

EHEC (enterohemorrhagic E. coli)Menghasilkan Verotoksin (= toksin Shiga)Penyebab kolitis hemoragik dan hemolytic uremic syndrome (HUS)Isolat tersering E. coli O157:H7 dan O26 (Jepang, 2001), sorbitol (-)Sumber penularan daging giling, susu

EIEC (enteroinvasive E. coli)Penyebab diare serupa dengan shigellosis, epitel mukosa kolon rusakLaktosa (-), tes Sereny (+)

EAEC (enteroaggregative E. coli)Kuman mampu menempel pada biakan sel dan membentuk agregatPenyebab diare akut / kronis pada anak, diare tanpa darah dan tidak menginvasi mukosa(?) plasmid mengkode toksin

SalmonellaBerdasarkan studi genetik, hanya ada spesies Salmonella entericaAda lebih dari 2400 serotipe Penyebab demam tifoid S. enterica serotype typhiNomenklatur yang sering dipakai di klinik S. typhi; S.enteritidis satu dan S. typhi; S. paratyphi.Hospes:Manusia S. typhi; S. paratyphi A, B, CBabi S. cholera-suisSapi S. dublinDomba S. abortus suisDosis infektif S. typhi: 106 - 109

Morfologi:Batang, Gram (-), gerak (+), anaerob fakultatifTidak meragi laktosa dan sukrosaMenghasilkan H2STahan suhu pembekuanAntigen:Ag OAg HAg K Ag Vi faktor virulensi

PatogenesisLumen usus - Bakteri berkembang biak

Menempel pd Mikrovili adhesin

Sel Mukosa berkembang biak

Menembus sub-mukosa

Lnn. Regional berkembang biakGejala klinis timbul sesudah bakteri menembus dinding ilium

Manifestasi KlinisDemam enterik (typhoid fever, tifus abdominalis)EnterokolitisBakteremia, dengan atau tanpa lesi fokal (metastase)

Patogenesis Salmonellosis

lnn. Mesenterika(berkembang biak)

Bakteremia I Darah

Organ tubuh(berkembang biak)

Bakteremia II Darah

Kelenjar empedu

UsusIliumS. typhi

Plaque Peyer dan lnn usus meradang nekrosis ulkus perforasi usus5 10% kasus yang tidak terobati akan mengalami RELAPS (pada minggu II atau III)Sebagian kecil akan menjadi CARRIER

Enterokolitis (gastroenteritis)Gejala: muntah, sakit perut, diare dan demamOnset: 6 48 jamDurasi: 2 hari 1 minggu, sembuh spontanPemeriksaan lab: feses (+) SalmonellaKeracunan makanan karena Salmonella (S. enteritidis, S. typhimurium) dibicarakan dalam kuliah khusus

S. enteritidisBakteri menempel pd epitel ilium terminalBakteri berkembang biak dlm lnn. hiperplasia dan hipertrofi SREInfeksi terbatas pada traktus gastrointestinalProstaglandin terlepascAMP meningkat sekresi cairan meningkatDIARE

Pemeriksaan LaboratoriumIsolasi bakteri e.g. Gaal KultuurSerologi e.g. Tes Widal, hanya berguna untuk demam enterik

TerapiDemam enterik dan Bakteriemia antibiotik:Khloramfenikol, ampisilin, trimetoprim sulfomethoxazol, sefalosporin

Enterokolitis:Diare berat penggantian cairan & elektrolitAntibiotik akan mempeerpanjang gejala klinis dan lamanya ekskresi kumanCarrier: kholisistektomi & antibiotik

PencegahanSanitasi makananVaksinasi

CampylobacterMorfo-fisiologi :Btg bengkok, S, spiral (lebih dari satu), Negatif Grambersifat kapnofilik (O2=5% , CO2=10%) , kelembaban 90%Oxydase (+), Catalase (+), reduksi nitrat (+), H2S (+); tdk meragi karbohidrat.suhu pertumbuhan (optimum) 37C

C.jejuni dpt hidup pd 42C, C.coli tidak dapat Toksin : memproduksi dua macam toxin: a. enterotoksin mirip dng Cholera-toxin A b. sitotoksin mirip dengan Shiga-toxin B

Patogenesis & patologi melalui makanan & minuman terinfeksi dengan inokulum 10 x 10 kuman dapat menimbulkan sakit (idem untuk kuman Salmonella & Shigella)

Kuman berkembang biak di usus halus menghslkan A invasi epithel feverB meningkatkan aktivitas toxin enteritisA & B tinja berdarah & banyak leukosit

Habitat alamiahnya: binatang unggas: burung liar, ayam broiler (tanpa memberikan gejala sakit) kolam air tawar yang tercemar tinja unggas

Helicobacter (d/h Campylobacter)Sejarah: Akhir abad 19 ditemukan (histo-patologik) jar. kadaver penderita gastritis kronik Campylobacter Like Organism (CLO)1981 Barry Marshall dpt mengasingkannya dari biopsi gaster penderita gastritis kronik Campylobacter1983 diakui sebagai etiologi Gatritis Chronic Helicobacter pylori (Gastritis Chronic = penyakit infeksi) Akhir2 ini dikenal sebagai pemicu Gastric Cancer

Morfo - fisiologisama dengan Campylobacter hanya flagel lebih dari satu, berselubung & poler. tidak meragi karbohydratemenghasilkan urease (dlm jumlah besar)tergolong kuman kapnofilik (kelembaban lingkungan pertumbuhan 90%)* Di alam bebas ditemukan dng bentuk morfologi yg berbeda (cocco-bacil)

Vibrio sp.Bakteri berbentuk batang bengkok, negati Gram, oksidase (+), bergerak dengan polar flagel, halofilikTermasuk dalam family VibrionaceaeSpesies penting:V. choleraeV. parahaemolyticusV. vulnificus

Vibrio choleraeKultur:Tumbuh pada media sederhana, koloni konveks, smooth, bulat, opaqueTumbuh baik pada suhu 37oCMedia eksklusif TCBSpH optimal 8.5 9.5

Ciri pertumbuhan:Tumbuh pada kadar garam 6% (Aeromonas tidak)Sensitif terhadap O/129 (Aeromonas tidak)

Penyebab kholera:V. cholerae O1 dan O139V. cholerae O1 bisa dibedakan atas :Serotipe Ogawa dan InabaBiotipe klasik dan El TorV. cholerae O139 mirip dengan V. cholerae O1 biotipe El Tor, tetapi mempunyai kapsul polisakharidaFaktor virulensinya adalah Enterotoxin

Patogenesis dan Patologi Kholera:Dosis infeksius 1010 atau lebihNon-invasiveMasa inkubasi 1 4 hariDiare berat berupa air seperti air cucian berasDapat mengakibatkan dehidrasi berat

Diagnosis laboratorium:Spesimen tinjaKultur dan identifikasi

Kekebalan:Asam lambungSesudah diare akan terbentuk imunitas terhadap reinfeksi

Terapi:Koreksi kekurangan air dan elektrolitTetrasiklin dapat mengurangi diare dan memperpen-dek durasi ekskresi vibrioDi daerah endemik Vibrio cholerae resisten terhadap tetrasiklin telah ditemukan

Epidemiologi dan Pencegahan:

Penyebab pandemi (telah 8x pandemi), yang terakhir pada tahun 1992-1993 disebabkan oleh serotipe O139Kolera endemik di Asia dan Asia TenggaraCarrier berlangsung 3-4 minggu, carrier kronis jarang.Kontrol sanitasi air dan makananKemoprofilaksis dapat diberikanVaksin tidak memberikan perlindungan menetap

V. parahaemolyticus dan lainnyaV. parahaemolyticus

Bakteri halofilikPenyebab gastroenteritis sesudah makan seafood yang terkontaminasiMasa inkubasi 12-24 jamDiare berair (kadang disertai darah), sakit perut, demam, muntahSembuh spontan dalam 1 4 hariTdk menghasilkan enterotoxinTumbuh pada TCBS agar koloni hijau

V. vulnificus:infeksi luka yang berat, bakteremia dan kadang gastroenteritisPada infeksi luka sering berlanjut bakteremia angka kematian tinggi; perlu pemberian antibiotik segeraDrug of choice (DOC) tetrasiklin; dapat pula diberikan ciprofloxacin

Vibrio mimicus:Menyebabkan diare sesudah makan seafood yang terkontaminasi

*******************************