DNA RNA Transkripsi&Translasi
Transcript of DNA RNA Transkripsi&Translasi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
1/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
2/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
3/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 3
Pendahuluan Biologi molekular : cab. ilmu (Biologi) yang
mempelajari organisme pada tingkat
molekular
Biologi molekular : cab. Ilmu (Biologi) yangmempelajari struktur dan peran biomolekul
dalam pelaksanaan segala aspek berbagai
fungsi kehidupan (Suryohudoyo, 1999)
Biologi molekular Sel : cabang ilmu Biologi
yang mempelajari fenomena hidup pada
tingkat molekul di dalam sel
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
4/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 4
Lanjutan
Penemuan struktur heliks ganda DNA (Watson
& Crick, 1953)
Didahului : gen (Mendel, 1853), gen terdapatdalam kromosom (Morgan et al., 1910-1915),
substansi Gen adalah asam nukleat (Griffith et
al.,1928 dan 1944)
Merupakan kelanjutan 2 cabang ilmusebelumnya : Genetika dan Biokimia
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
5/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 5
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
6/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 6
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
7/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 7
Kromosom Manusia
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
8/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 8
Lanjutan
Perkembangan Biologi molekular
menjadi semakin pesat dengan
ditemukannya rekayasa genetika(genetic engineering) yang
memungkinkan penggandaan dan isolasi
gen sehingga struktur dan fungsi gen
dapat dipelajari.
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
9/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 9
Ruang Lingkup
Sangat luas : bidang Kedokteran, Farmasi,Biologi, Pertanian, Kedokteran Hewan dll.
Farmasi : kaitannya dengan obat (detail
farmakodinanamik dan farmakokinetik, dll) Kedokteran : - Dasar (mis : Histologi, Fisiologi,
Genetika)
- Pre-klinik (mis : Mikrobiologi,
Parasitologi, Farmakologi)- Klinik (mis : Peny. Dalam, IKA,
Peny. Kulit)
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
10/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 10
Dogma sentral
transkripsi
DNA RNA Protein
replikasi
translasi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
11/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 11
DNA
PENYUSUN
KROMOSOM
DI-IKAL DALAM
SUATU
PROTEIN
HISTON
CHROMATIN
NUCLEOSOME
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
12/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 12
DNA
Deoxyr ibonucleic Acid = Asam Deoksiribonukleat : materi genetik yang dapatdiwariskan. DNA secara tepat bereplikasi
selama setiap generasi selDNA mengendalian aktivitas sel
Gen : unit informasi di dalam DNA. Setiap genmenentukan rangkaian asam amino suatu
protein tertentu. Ribuan hingga jutaan genyang berlainan diperlukan untuk membuatsemua protein penting dalam sel
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
13/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 13
Struktur DNA
DNA molekul untai ganda yang terdiri atas 2
pasang nukleotida
Setiap nukleotida terdiri atas :- Deoksiribosa : suatu gula berkarbon-5
- Gugus fosfat : terikat pada karbon 5deoksiribosa
- Basa nitrogen : terdiri atas 4 jenis yang berbeda (2
purin dan 2 pirimidin)
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
14/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 14
Struktur DNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
15/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 15
Struktur Nukleotida,
basa purin dan pirimidin
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
16/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 16
RNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
17/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 17
Perbedaan struktur gula antara RNA dan DNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
18/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 18
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
19/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 19
RNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
20/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 20
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
21/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 21
Pengertian dan Tujuan Replikasi DNA
Salah 1 ciri kunci DNA adalah kemampuanbereplikasi sehingga salinan identik gen dapatditeruskan ke generasi berikutnya. Setiap molekul
DNA menyiapkan cetakannya sendiri untuk replikasi Replikasi DNA adalah proses penggandaan
molekul DNA untai ganda. Pada sel, replikasi DNAterjadi sebelum pembelahan sel. Prokariota terus-menerus melakukan replikasi DNA. Pada eukariota,
waktu terjadinya replikasi DNA sangatlah diatur,yaitu pada fase S daur sel, sebelum mitosis ataumeiosisI.
http://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Sel_%28biologi%29http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pembelahan_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Prokariotahttp://id.wikipedia.org/wiki/Eukariotahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Daur_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Mitosishttp://id.wikipedia.org/wiki/Meiosishttp://id.wikipedia.org/wiki/Meiosishttp://id.wikipedia.org/wiki/Mitosishttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Daur_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Daur_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Daur_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Eukariotahttp://id.wikipedia.org/wiki/Prokariotahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pembelahan_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pembelahan_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pembelahan_sel&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Sel_%28biologi%29http://id.wikipedia.org/wiki/DNA -
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
22/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 22
Siklus sel
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
23/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 23
Tahapan Replikasi
Denaturasi (pemisahan untai DNA)
Inisiasi Elongasi (pemanjangan)
Ligasi fragmen DNA
Terminasi (pengakhiran)
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
24/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 24
Replikasi pada prokariot
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
25/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 25
Replikasi DNA Prokariota
Tahap Inisiasi
Replikasi dimulai pada daerah OriC
Beberapa protein terlibat pada tahap inisiasireplikasi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
26/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 26
lanjutan
Tahap Inisiasi
Protein yang diperlukan pada inisiasi replikasi
DNA: DnaA membuka heliks DNA pada OriC DnaB (helikase) unwindingDNA
memerlukan ATP
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
27/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 27
Replikasi DNA Prokariota
Tahap Inisiasi
DnaB (helikase)pd prokariota ada 2: helikase II (utk lagging
strand) & prot Rep (utk leading strand)
Helikase IIProtein Rep
Leadingstrand
Laggingstrand
3
5
5
3
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
28/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 28
Replikasi DNA Prokariota
Tahap Inisiasi
SSBP (single stranded binding protein) mempertahankan DNA tetap dalam bentuk
untai tunggalTidak perlu ATP
Helikase IIProtein Rep
3
5
5
3SSBP
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
29/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 29
Replikasi DNA Prokariota
DnaC diperlukan untuk pengikatan DnaBpada OriC
DnaG (primase) sintesis primer RNA DNA girase (DNA topoisomerase II) membentuk negative supercoiled DNAuntuk
membebaskan tegangan torsional yang
disebabkan oleh aktivitas helikase membantu proses unwindingberikutnya
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
30/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 30
Garpu replikasi
Garpu replikasi atau cabang replikasi
(replication fork) ialah struktur yang terbentuk
ketika DNA bereplikasi. Garpu replikasi ini
dibentuk akibat enzim helikaseyang memutus
ikatan-ikatan hidrogen yang menyatukan
kedua untaian DNA, membuat terbukanya
untaian ganda tersebut menjadi dua cabang
yang masing-masing terdiri dari sebuah
untaian tunggal DNA.
http://localhost/var/www/apps/conversion/tmp/scratch_8/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://localhost/var/www/apps/conversion/tmp/scratch_8/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://localhost/var/www/apps/conversion/tmp/scratch_8/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://localhost/var/www/apps/conversion/tmp/scratch_8/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://localhost/var/www/apps/conversion/tmp/scratch_8/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://localhost/var/www/apps/conversion/tmp/scratch_8/wiki/Ikatan_hidrogen -
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
31/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 31
lanjutan
Masing-masing cabang tersebut menjadi
"cetakan" untuk pembentukan dua untaian
DNA baru berdasarkan urutan nukleotida
komplementernya. DNA polimerase
membentuk untaian DNA baru dengan
memperpanjang oligonukleotida yang
dibentuk oleh enzim primase dan disebutprimer
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
32/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 32
Replikasi DNA Prokariota
Tahap Elongasi
Sintesis DNA dikatalisis oleh enzim DNA
Polimerase. DNA polimerase membentuk
untaian DNA baru dengan memperpanjangoligonukleotida yang dibentuk oleh enzim
primasedan disebutprimer
Pada prokariota ditemukan 3 tipe DNApolimerasi: DNA polimerase I, II dan III
Fragmen Okazaki disambung oleh DNA ligase
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
33/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
34/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 34
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
35/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 35
Model replikasi DNA
Replikasi semikonservatif : Tiap molekul DNAanak, 1 untai DNA parental (lama) dipertahankanuntuk berpasangan dengan 1 untai DNA yang barudisintesis. Sebaliknya pada pada pola konservatif :
akan menghasilkan 1 molekul DNA parental utuhdan 1 molekul DNA anak yang benar-benar baru.
Replikasi DNA sangat cepat dan akurat :Diperkirakan 500 nukleotida direplikasi setiap detikdan diperkirakan terdapat 1 kesalahan dalam 1
miliar pasang basa (bp). Merupakan kekuasaanAllah yang menakjubkan (ukuran genom eukariotiksekitar 3 miliar bp DNA dalam sebuah inti sel)
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
36/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 36
Semi-konservatif
Untaian baru
disintesis dari ujung5 ke ujung 3
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
37/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 37
Enzim yang terlibat dalam Replikasi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
38/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 38
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
39/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 39
Replikasi DNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
40/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 40
Leading strand
Untaian DNA yang disintesis dengan arah
5'3' secara berkesinambungan. Pada
untaian ini, DNA polimerase mampu
membentuk DNA menggunakan ujung 3'-OH
bebas dari sebuah primer RNA dan sintesis
DNA berlangsung secara berkesinam-
bungan, searah dengan arah pergerakangarpu replikasi.
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
41/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 41
Lagging strand
Sintesis fragmen-fragmen Okazaki
Fragmen Okazaki diligasi untukmembentuk untai yang lengkap
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
42/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 42
lanjutan
DNA ligase
Menyambung fragmen Okazaki, perlu energi Mengkatalisis pembentukan ikatan
fosfodiester antara ujung 3-OH pada DNA
yang satu dengan ujung 5-P pada DNA yang
lain
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
43/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 43
Replikasi DNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
44/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 44
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
45/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 45
Replikasi pada Eukariot
Prinsip hampir sama
Terdapat 5 macam DNA
polimerase (DNA polimerase)
ORI terdapat dalam jumlah banyak
Pergerakan garpu replikasi lebihlambat
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
46/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 46
Fungsi enzim DNA polimerase
DNA polimerase : mengawali replikasi pada 2
untai
DNA polimerase : pemanjangan kedua untai
DNA polimerase : reparasi DNA
DNA polimerase : reparasi DNA
DNA polimerase : replikasi DNA mitokondria
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
47/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 47
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
48/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 48
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
49/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 49
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
50/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 50
Transkripsi
Transkripsi : proses penyalinan kode-kodegenetik yang ada pada urutan DNA menjadimolekul RNA. Merupakan proses yan
mengawali ekspresi sifat-sifat genetik yangnantinya muncul sebagai fenotip
RNA: selalu singlestranded
Pada proses transkripsi hanya 1 untai DNA
yang disalin DNARNA Sintesis RNA : 53
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
51/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 51
Molekul RNA
Pada proses transkripsi dapat dibedakan menjadi 3kelompok molekul RNA :
- mRNA (messenger RNA) : salinan kode genetik pada
DNA yang pada proses translasi akan diterjemahkan
menjadi urutan asam amino yang menyusun suatu
polipeptida atau protein tertentu
- tRNA (transferRNA) : berperanan membawa asam
amino spesifik yang akan digabung pada proses
translasi (sintesis protein)- rRNA (ribosomalRNA) : digunakan untuk menyusun
ribosom sebagai tempat sintesis protein
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
52/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 52
lanjutan
Transkripsi Translasi Jalur biokimia
mRNA Protein Fenotip
DNA tRNA
rRNA
tRNA dan rRNA tidak pernah ditranslasi karenamolekul yang digunakan adalah RNA-nya itu sendiri
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
53/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 53
Prokariot vs eukariot
Tidak memiliki membran inti(tidak ada pemisahan yang
jelas). Sebelum transkripsiselesai translasi sudahberlangsung
Hanya memiliki 1 jenis RNApolimerase
Memiliki sistem operon
mRNA polisitronik
Gen terdiri atas ekson (tidakada splicing)
Memiliki membran inti(terdapat pemisahan yang
jelas). Translasi berlangsungsetelah transkripsi selesai.Transkripsi di inti, translasi di
sitoplasma memiliki 3 jenis RNA
polimerase
Tidak ada sistem operon
mRNA monosistronik
Gen terdiri atas ekson danintron (ada splicing)
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
54/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 54
Struktur gen Prokariot
upstream
region
transcribed
regiondownstream
region
promoter(RNA polymerase
binding site)
transcriptionstart site
terminationsite
gene dsDNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
55/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 55
RNA Polym erase Enzyme
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
56/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 56
RNA Polym erase Enzyme
RNA Polym erase Enzyme
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
57/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 57
RNA Polym erase Enzyme
RNA Polymerase Enzyme
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
58/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 58
RNA Polymerase Enzyme
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
59/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
60/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 60
1 T pical bacterial 70 promoter
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
61/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 61
1. Typical bacterial 70promoter
TTGACA TATAATAACTGT ATATTA
TATAAT=-10 consensus
sequence
TTGACA=-35 consensus
sequence
*also calledPribnow box;~ 10 bases before start
site of transcription
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
62/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 62
A more common way to draw a promoter
TTGACA TTAACT
-10-35
Note:
The - 10 and -35 sequences can vary somewhat.
5' 3'
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
63/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 63
A Simple Gene
Protein Coding Region
Terminator
SequencePromoter/
Control Region
Transcription
Start Site 3 Untranslated Region5 Untranslated Region
35
RNA Transcript
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
64/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 64
Mekanisme transkripsiTahapan transkripsi dapat dibagi menjadi 3 :
1. Inisiasi
2. Elongasi
3. Terminasi/pengakhiran
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
65/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 65
Penjelasan Ringkas Sintesis RNA
Faktor yang mengendalikan transkripsimenempel pada bagian promoter
Penempelan tersebut menyebabkan
terbentuknya kompleks promoter terbuka RNA polimerase membaca cetakan (DNA
template) dan terjadi proses pemanjangan
Pengakhiran (terminasi) ditandai dengan
pelepasan RNA polimerase dari DNA yangditranskripsi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
66/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 66
Inisiasi Transkripsi
Pembentukan kompleks promoter tertutup
Pembentukan kompleks promoter terbuka
Penggabungan beberapa nukleotida awal(sekitar 10 nukeotida)
Perubahan konformasi RNA polimerase
karena subunit/faktor dilepaskan darikompleks holoenzim
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
67/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
68/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 68
Elongasi/Perpanjangan
Pada gelembung transkripsi, basa
molekul RNA membentuk hibrid dengan
cetakan DNA 12 nukleotida Hibrid bersifat sementara, setelah RNA
polimerase berjalan, hibrid lepas dan
DNA yang terbuka menutup lagi
RNA polimerase berjalan membaca DNA
cetakan untuk proses pemanjangan
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
69/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 69
Pengakhiran Termination)Transkripsi
Rho-independent : terdapat struktur jepit
rambut (hairpin) yang kaya akan GC Rho-dependent : terdapat struktur jepit
rambut yang kaya akan AU
Termination
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
70/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 70
RNAPol.
5
RNA
RNAPol.
5
RNA
RNAPol.
5RNA
Rho Independent
Terminator
Terminasi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
71/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 71
RNAPol.
5
RNA
Rho Dependent
Terminator
RNAPol.
5RNA
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
72/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 72
Produk Transkripsi
1. Ribosomal RNA (rRNA)- Several rRNAs arevital constituents of ribosomes
2 Transfer RNA (tRNA)- The molecule thatphysically couples nucleic acid codons with
specific amino acids
3 Messenger RNA (mRNA)- The nucleic acid
messenger that carries encoded information from geneson DNA to the protein manufacturing ribosomes
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
73/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 73
Contoh RNA hasil transkripsi
5- AAG TTC GCT GTA GGC -3 untai DNA pengkode
3- TTC AAG CGA CAT CCG -5 untai DNA cetakan
Transkripsi
5- AAG UUC GCU GUA GGC -3 RNA hasil transkripsi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
74/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 74
Transkripsi Eukariot Enzim RNA Polimerase
Elemen kontrol DNA Faktor Transkripsi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
75/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 75
Tiga jenis RNA PolimerasePada Eukariot:1. RNA polimerase I:
Transkripsi gen kls I: 5,8 S. 18S. 28S, 45S
rRNA
2. RNA polimerase II:
Transkripsi gen kls II :mRNA dan sebag.
Besar UsnRNA, kecuali U6snRNA
3. RNA polimerase III:
Transkripsi gen kls III : RNA kecil seperti 5S
RNA, tRNA, 7SK RNA, U6 snRNA.
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
76/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 76
The expression of rRNA and
tRNA is similar in eukaryotesand prokaryotes.
1.Expression of eukaryotic
rRNA and tRNA genes
Transkripsi Eukariot
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
77/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 77
RNA Polimerase
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
78/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 78
ELEMEN promoter
Contoh: promoter gen SV40
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
79/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 79
Faktor Transkripsi
Protein
Ada 2 jenis:
- berikatan dengan DNA(DNA binding protein)
- tidak berikatan dengan DNA (non DNA
binding protein)
DNA binding protein sebagai faktor transkripsimempunyai 2 domain:
- domain untuk berikatan dengan DNA
- domain untuk aktivasi transkripsi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
80/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 80
Faktor transkripsi
Diperlukan untuk sintesis semua mRNA
Mengenali urutan promoter basal spesifik
Menentukan situs inisiasi transkripsiMenginstruksikan RNA polimerase II ketempat tersebut
Bersama-sama dengan RNA polimerase dan
promoter basal membentuk Kompleksinisiasi Transkripsi
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
81/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 81
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
82/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 82
Enhancer Element atau
Elemen penguat
Biasanya terpisah jauh dari titik inisiasitranskripsi, di daerah 5(upstream)
Tidak bekerja sebagai promoter tetapi
menguatkan kerja promoter dengan caraberinteraksi dengan protein yang berikatandengan DNA
Bekerja hanya pada tipe sel tertentu yang
spesifik Regulasi kerja oleh sinyal tertentu yang
dapat menginduksinya
2 Eukaryotic protein expression
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
83/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 83
geneE I I IE E E
E = exon = coding sequencesI = intron = intervening,
noncoding sequences
2.Eukaryotic protein expressionTypical eukaryotic genes have exons and introns.
Eukaryotes do NOT have operons
1 gene with exons and introns
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
84/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 84
1 gene with exons and intronsE I I IE E E
transcription
1 RNA representing exons and introns
(primary transcript)
Primary transcripts
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
85/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 85
primary transcript
1 polypeptide
1 mRNA
processing
Primary transcripts
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
86/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 86
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
87/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 87
c. Processing of primary transcripts
i. capping
ii. splicing
iii. tailing
i Capping
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
88/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 88
i. CappingAddition of a 5' cap
CAP
Capping usually occurs before
transcription is finished.
ii Splicing
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
89/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 89
ii. Splicing
The removal of introns.
primary transcript
splicing
RNA without introns
iii Tailing
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
90/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 90
Addition of a poly-A tail
iii. Tailing
A1A2...A~200
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
91/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 91
3.Notes on eukaryotic RNA processing
Processing occurs in the nucleus
The exact order of capping, tailingand splicing varies for different genes.
Poly-A tails are added by poly-A
polymerase, NOT during transcription.
Comparation of eukaryotic and
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
92/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 92
Eukaryotic mRNAs are usually
spliced,capped and tailed.
Eukaryotes do NOT have operons.
tRNA and rRNA expression are
generally similar
Prokaryotic genes very very rarely
have introns
procaryotic expression
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
93/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 93
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
94/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 94
Translasi
Proses penerjemahan urutan nukleotida
dari mRNA menjadi rangkaian asam
amino yang menyusun polipeptida atau
protein
Translasi terjadi di ribosom
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
95/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 95
Ribosom
Pada prokariot
tersebar di seluruh
bagian sel
Pada eukariot terletakdi sitoplasma,
khususnya di
permukaan membran
retikulum endoplasma
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
96/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 96
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
97/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 97
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
98/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 98
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
99/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
100/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
101/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 101
Protein synthesis - Part 2 Chain elongation Next complementary tRNA comes into the
A site
The amino acid from the tRNA at the P siteis attached to the amino acid on the tRNAat the A site
Translocation
The mRNA moves the tRNA at the A site to the Psite
The next tRNA can go into the P site
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
102/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 102
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
103/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 103
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
104/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 104
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
105/111
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
106/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 106
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
107/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 107
RIBOSOME BINDING SITE
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
108/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 108
SIGNAL AWAL TRANSLASI
Ribosomes initiate translation at ribosome-binding sites
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
109/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 109
07_33_mRNA.encode.jpgin polycistronic procaryotic mRNAs, which can encode
more than one protein
-
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
110/111
Feb-14 Biomed-FJR-FK-UII 110
http://www.wallpaper.free-animations.co.uk/butterflies/wallpaper_image_66.html -
8/13/2019 DNA RNA Transkripsi&Translasi
111/111
http://www.wallpaper.free-animations.co.uk/butterflies/wallpaper_image_66.html