Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

download Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

of 18

Transcript of Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    1/18

    Orlando

    102012430

    Kelompok D

    Fakultas Kedokteran Universitas Kristen KridaWacana

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    2/18

    DeteksiGen

    Normal /

    Abnormal

    DNA

    Rekombinan

    Rekayasa

    Genetika

    PCR

    Sequencing

    Southern

    blotting

    Enzim

    retriksi

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    3/18

    Gen bagi protein P diisolasi dan sekuens DNA

    nya telah ditentukan. Gen tersebut ditemukan

    mengandung 1000 bp sekuens pengkode dan dua

    situs enzim retriksi EcoRI, -GAATC-. Satu

    diantara kedua situs tersebut terletak 150 bpkearah dalam gen dari kodon start dan satunya

    lagi 150 bp ke arah dalam dari kodon stop . Telah

    ditemukan suatu protein P detektif, dan gennya

    pun telah diklona serta di sequencing. Dalam genyang abnormal, salah satu sekuens tersebut telah

    berubah menjadi GCATTC- .Kita ingin tahu

    apakah sel-sel janin mengandung gen normal

    atau abnormal.

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    4/18

    Enzim retriksi : enzim bakteri yang

    mengenali memotong sekuens nukleotidadi

    dalam molekul DNA berantai ganda

    Kodon awal merupakan kodon pertama yangditerjemahkan pada saat translasi atau

    disebut juga kodon inisiasi (AUG yang

    menyandikan metionin)

    Kodon akhir merupakan salah satu dari tigakodon, yaitu UAG, UAA atau UGA.Kodon akhir

    disebut juga kodon terminal yang tidak

    menyandikan asam amino

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    5/18

    Rumusan asalah

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    6/18

    Rekayasa Genetika digunakan untuk

    mengetahui mutasi protein pada

    tingkat gen

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    7/18

    Mengetahui bagaimana terjadinya DNA

    rekombinan

    Mengetahui teknik rekayasa genetika /

    rekombinanMengetahui hasil rekayasa genetika dan DNA

    rekombinan

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    8/18

    Rekayasa genetika adalah tindakan sengaja

    untuk memodifikasi DNA (substansi kimiawi

    dalam kromosom yang bertanggung jawab

    atas pewarisan sifat).Dalam arti luas, Tettamanzi melukiskannya

    sebagai bentuk-bentuk manipulasi dan

    pergantian tatanan gen dari organisme

    hidup. Bahan genetik DNA mengandunginformasi keturunan yang dimiliki oleh

    makhluk hidup

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    9/18

    DNA recombinanadalah DNA yangrangkaian zat kimiapenyusunannya

    dipotong kemudiandisisipkan ataudisambungkandengan DNA baru

    yang membawasifat unggul,seperti yangdiinginkan.

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    10/18

    Untuk mengetahui informasi genetik tersebut

    digunakan teknik DNA Sequencing, yaitu

    metode yang digunakan untuk menentukan

    urutan basa nukleotida (adenine, guanine,cytosine dan thymine) pada molekul DNA.

    DNA sequencing menggunakan metode PCR

    (Polymerase Chain Reaction) sebagai

    pijakannya

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    11/18

    Reaksi rantai polimerase (PCR polymerase

    chain reaction) merupakan suatu metode

    untuk membuat salinan seg,men spesifik dari

    suatu DNAMateri awal untuk PCR adalah suatu larutan

    DNA untai ganda yang mengandung urutan

    nukleotida yang ditargetkan untuk disalin

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    12/18

    DNA dipanaskan secara singkat untuk

    memisahkan untainya dan kemudian

    didinginkan untuk membiarkan primer

    berikatan dengan ujung-ujung urutan targetmelalui ikatan hydrogen , satu primer pada

    setiap untai.

    DNA polymerase menambahkan nukleotida

    pada ujung 3 primerwaktu kira-kira 5 menit urutan DNA target

    (yang panjangnya bisa mencapai ratusan

    basa) telah digandakan.

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    13/18

    larutan ini kemudian dipanaskan lagi,

    memulai siklus pemisahan yang lain,pegikatan primer, dan sintesis DNA

    hampir semua molekul DNA yang dihasilkan

    akan terdiri atas urutan target yang tepat

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    14/18

    Enzim restriksi endonuklease adalah enzim

    bakteri yang mengenali memotong sekuens

    nukleotidadi dalam molekul DNA berantai

    ganda. Enzim ini memotong DNA menjadi

    fragmen panjang yang bervariasi, bergantung

    pada berapa banyak situs yang dikenali

    enzim tersebut berada di dalam molekul

    DNA.

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    15/18

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    16/18

    Southern blott merupakan prosesperpindahan fragmen DNAyang terpisahsecara elektroforesisdari gel ke membran

    Prinsipnya adalah kapilaritas, dimana bufer

    yang merupakan fase gerak diasumsikan akanmembawa fragmen DNA dari gelke membran

    Metode inimengkombinasikan elektroforesisgel agarosa

    untuk memisahkan DNA berdasarkanukurannya dan kemudian ditransferke membranfilter untuk selanjutnyadilakukan hibridisasidengan probe

    http://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Elektroforesishttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Kapilaritas&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Gelhttp://id.wikipedia.org/wiki/Elektroforesishttp://id.wikipedia.org/wiki/Membranhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hibridisasihttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Probe&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Probe&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Hibridisasihttp://id.wikipedia.org/wiki/Membranhttp://id.wikipedia.org/wiki/Elektroforesishttp://id.wikipedia.org/wiki/Gelhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Kapilaritas&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Elektroforesishttp://id.wikipedia.org/wiki/DNA
  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    17/18

    Pemeriksaan kromosom dan DNA dengan teknikrekombinasi DNA dapat membantu untukmendiagnosis penyakit dan juga mengetahuistatus gen. Pemeriksaan ini dilakukan dalam

    tahap tertentu yang dimulai dari pemotonganDNA menggunakn enzim restriksi. Enzim restriksiyang digunakan adalah ECO-R1 yang berasal daribakteri e-coli dengan ciri pemotongan sticky enddengan urutan basa nitrogen yang sama yaitu

    GAATC. Melalui teknik rekombinasi gen dapatmengetahui terjadinya mutasi protein padatingkat gen sehingga dapat kita kenali gentersebut normal atau abnormal.

  • 5/26/2018 Deteksi Gen Dan Kromosom Manusia Dengan Teknik Dna

    18/18