DASAR-DASAR BIOKIMIAPERTEMUAN KE-2

FILOGENETIK SEL

SEL PROKARIOT

Karakteristik :Kompleksitas struktur relatif sederhanaBelum memiliki intiTidak ada mitokondria/plasmidDNA kromosom tersebar.DNA PLasmid

SEL EUKARIOT

Beberapa Fungsi Organel SelSitoplasma:Penyusun utama dari sitoplasma adalah air (90%), berfungsi sebagai pelarut zat-zat kimia serta sebagai media terjadinya reaksi kirnia sel.Dinding Sel : dinding sel adalah struktur di luar membran plasma yang membatasi ruang bagi sel untuk membesar. Dinding sel merupakan ciri khas yang dimiliki tumbuhan, bakteri, fungi (jamur), dan alga.Mitokondria : merupakan pabrik energi bagi sel eukariot dimana organel ini mengandung sejumlah enzim yang secara bersama-sama berperan dalam proses oksidasi zat makanan menjadi energi kimia dalam bentuk senyawa ATPKloroplas : tempat terjadinya reaksi fotosintesis.Nukleus (inti sel) : yang terdiri dari nukleolus (anak inti), berfungsi mensintesis berbagai macam molekul RNA (asam ribonukleat) digunakan dalam sintesis ribosom dan kromosom yang mengandung DNA (asam dioksiribonukleat) yang berfungsi menyampaikan informasi genetik.Retikulum Endoplasma : Memodifikasi protein yang disintesis oleh ribosom untuk disalurkan ke kompleks golgi dan akhirnya dikeluarkan dari sel. Mensintesis lemak dan kolesterol, ini terjadi di hati(RE kasar dan RE halus) Menetralkan racun (detoksifikasi) misalnya RE yang ada di dalam sel-sel hati. Transportasi molekul-molekul dan bagian sel yang satu ke bagian sel yang lain.Ribosom : Tempat sintesis protein. Ribosom berdiameter sekitar 20 nm serta terdiri atas 65% RNA ribosom (rRNA) dan 35% protein

Aspek Kimiawi Biomolekul

Semua komponen senyawa kimia yang terdapat di dalam makhluk hidup memiliki komposisi yang relatif berbeda dengan komposisi zat kimia yang terdapat di luar makhluk hidup.

Komponen biomolekul merupakan turunan dari senyawa hidrokarbon (gabungan antara senyawa karbon dan hidrogen dengan kerangka dasar atom karbon

Kerak bumiTubuh manusiaUnsur% Jml atomUnsur% Jml atomO47H63Si28O25.5Al7.9C9.5Fe4.5N1.4Ca3.5Ca0.31Na2.5P0.22K2.5Cl0.08Mg2.2K0.06

Komposisi biomolekul di dalam sel

STEREOISOMER BIOMOLEKUL

Konfigurasi biomolekul organik mempengaruhi aspek biokimia

Interaksi antar biomolekul bersifat stereospesifik

Aconitase binding pocketAconitase is an enzyme that catalyses the stereo-specific isomerization of citrate to isocitrate via cis-aconitate.

AIR & BUFFER DALAM MAKHLUK HIDUP

Struktur Molekul Air

Struktur molekul air (a) 2 pasang elektron bebas membentuk struktur tetrahedral (b) model bola (c) Dua molekul air dihubungkan oleh ikatan hidrogen

Karakteristik air sebagai pelarut

Beberapa jenis ikatan hidrogen yang terjadi dalam biomolekul

Air melarutkan berbagai kristal garam dengan menghidrasi komponen ionnya

Interaksi molekul air dengan molekul non polar

Mekanisme reaksi enzim dengan substrat dimediasi oleh molekul air

Perbedaan tekanan osmosis akibat adanya senyawa terlarut dalam air menyebabkan air memiliki kemampuan menembus membran sel.TEKANAN OSMOSIS SEL

Konstanta Kesetimbangan Asam-Basa Mencerminkan Sifat Air

H2O H+ + OH-

Konstanta disosiasi (Ka) asam lemah

Contoh sistem buffer dalam tubuh

Conservation of Bicarbonate Ions

Electrolyte Balance