Alur laut kepulauan Indonesia yang menghubungkan dua lautan bebas Samudera Hindia dan Pasifik meliputi

ALKI I yang melintasi Laut Cina Selatan-Selat Karimata-Laut Jawa-Selat Sunda dengan cabang ALKI I-A yang melintasi Selat Singapura-Laut Natuna.

ALKI II melintasi Laut Sulawesi-Selat Makasar-Laut Flores-Selat Lombok.

ALKI III yang melintasi Samudera Pasifik-Selat Maluku-Laut Seram-Laut Banda, dengan cabang AKLI III-A dari Samudera Pasifik ke Samudera Hindia melintasi Laut Maluku-Laut Seram-Laut Banda-Selat Ombai-Laut Sawu, ALKI III-B dari Samudera Pasifik ke Samudera Hindia melintasi Laut Maluku-Laut Seram-Laut Banda-Selat Leti, ALKI III-C Samudera Pasifi ke Laut Arafura melintasi Laut Maluku-Laut Seram-Laut Banda, ALKI III-D dari Samudera Pasifik ke Samudera Hindia melintasi Laut Maluku-Laut Seram-Laut Banda-Selat Ombai-Laut Sawu, ALKI III-E dari Samudera Hindia ke Laut Sulawesi melintasi Laut Sawu-Selat Ombai-Laut Banda-Laut Seram-Laut Maluku.